Para sustituir a Ernesto Valverde en el banquillo, la junta directiva contrató a José Luis Mendilibar, proveniente de la S. D. Eibar de Segunda División, el cual fue cesado debido al nefasto inicio de Liga (el segundo peor de la historia del Athletic). A partir de 2005, el Athletic entraría en una época de crisis institucional y deportiva, camisetas del real madrid que casi hacen descender al club. Su técnica entre los jugadores del puesto hizo que pronto ganara la titularidad relegando a Raúl Cascini.
